O omeprazol pode inibir a secreção de ácido gástrico, clinicamente utilizadas para tratamento da azia e refluxo ácido causada pelo excesso de ácido gástrico. Além disso, omeprazol comprimidos com revestimento entérico de magnésio é utilizado para o tratamento de úlcera duodenal, úlcera gástrica e esofagite de refluxo: combinada com antibióticos para o tratamento de úlcera duodenal com Helicobacter pylori ; tratamento de não-hormonais relacionadas com a droga úlcera péptica gastroduodenal e erosão; utilizada para evitar a não-hormonais induzidas por drogas úlcera péptica gastroduodenal, erosão ou indigestão sintomas; também para o tratamento a longo prazo da doença crônica recidivante de úlcera péptica e esofagite de refluxo; tratamento sintomático de pirose e regurgitação causada pela doença do refluxo gastro-esofágico; tratamento sintomático de sintomas de úlcera e dispepsia relacionados com ácido; tratamento da síndrome Zollinger-Ellison.